Cellatlasen publicerar unika resultat i Science

| Av Mikael Mildén | Tipsa redaktionen

Human protein atlas-projektet publicerar nu den första övergripande kartan över var proteinerna befinner sig i cellen. Artikeln återfinns i Science.

Efter mer än 10 års vetenskapligt arbete i forskningsprojektet Human protein atlas lanserades Cellatlasen i december. Nu följer publiceringen i Science, där projektet analyserat hundratusentals bilder över cellens proteiner tillsammans med forskargrupper i Kina, Sydkorea, Danmark och Tyskland.

Totalt har 12 003 proteiner kartlagts med hjälp av 13 993 antikroppar, proteinerna har klassificerats till en eller flera av 30 cellulära strukturer, och totalt definierar det proteomen hos 13 större organeller. Här kan man notera att hälften av proteinerna finns i mer än en struktur, ett tecken på hur komplex cellen är.

Läs också: Cancerforskning i återvändsgränd

– Vi måste studera de molekylära enheterna i kroppens minsta funktionella enhet, cellen, för att få en fullständig förståelse för människans biologi, säger Professor Mathias Uhlén på KTH, ledare för forskningsprojektet Human protein atlas.
Läs också: AstraZeneca öppnar substansbibliotek


Emma Lundberg, docent vid KTH och ansvarig för High content microscopy-anläggningen vid Scilifelab, ansvarar för arbetet med kartläggningen av cellen. Hon poängterar att arbetet kommer att utgöra en enorm resurs för framtida forskning.

– Cellatlasen är en gratis kunskapsresurs som kan användas av forskare runt om i världen för att studera proteiner eller organeller av intresse, vilket gör det möjligt att studera systembiologi och skapa cellmodelleringsapplikationer. Den går också att använda för maskininlärningstillämpningar för bildmönsterigenkänning eftersom det finns ett mycket stort antal välannoterade bilder att använda sig av, säger hon.



Håll dig uppdaterad med Life Science Sweden
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.


Skriv din kommentar

Mest läst

Startsidan just nu

Annons: Assistenter/apotekstekniker till ApoEx team i Stockholm

Konsensus i Almedalen

AstraZeneca öppnar substansbibliotek

Chemical Biology Consortium Sweden (CBCS), en del av SciLifeLab, startar ett nytt forskningssamarbete med AstraZeneca.

Klinisk diabetesforskning prisas

Läkemedelsbolag drabbat av cyberattacken

Flera globala företag har den senaste veckan drabbats av den virusattack som startade den 27 juni. Även storbolag inom life science-sektorn har smittats.

Ny fas för Frisq

Långsiktig effekt av psoriasisbehandling

Arkiv

Först i världen med barnmorska på videolänk

Ingen effekt av akupunktur

Immunovia etablerar huvudkontor i USA

Allergitest får global distribution

Senzagen har tecknat ett globalt distributionsavtal med Charles River laboratories.

Stort anslag för kontroll av biologiska läkemedel

Novartis får ok för nytt läkemedel mot bröstcancer

Han blir rektor vid Karlstads universitet

Replik: Kommittéerna ger ojämlik vård

Digitalisering och kliniska prövningar

Krönika: Förändringar krävs för digitaliseringen

Sjukvården har hamnat på efterkälken i den digitala omställningen, skriver Cecilia Lunell, kommunikationskonsult på Narva.

Uppsala inför ny behandling mot cancer

Svenska bolagen som deltog på världens största mässa

BIO i San Diego är världens största bioteknikmässa, och självklart var ett flertal bolag från den vibrerande svenska life science-branschen på plats. Ola Björkman rapporterar direkt från USA.

Nu får de testa cancerläkemedel på barn

Barncancervården på Sahlgrenska har godkänts som kliniskt prövningscentrum för att utvärdera läkemedel på barn.

Sociala medier hittar försökspersoner

Positiva resultat för insulinpump

Svenskt bolag in i Sydafrika

Ska förbereda bolagen på riskkapital

Ny vd i Active biotech

Lidds tankar kassan

Ny vd för Pledpharma på plats

Alan Raffensperger går vidare

Ny general manager till CGM

Trendbrott i investeringar till forskning

Vigmeds CFO lämnar

300 miljoner till systembiologi

Medicpen har utsett sin nya vd

Tar styrelseplats i Nanologica

Reumatikerförbundet fick sin ordförande

Alexander Ahlberg blir ny klinik-vd

Sänd till en kollega

0.17