23948sdkhjf

Ny metod för att jämföra texter och genom

Textanalysmetoder som tidigare använts till att upptäcka litterära plagiat och tentafusk har inspirerat en ny metod för att ordna organismer evolutionärt i evolutionära träd.
Textanalysmetoder som tidigare använts till att upptäcka litterära plagiat och tentafusk har inspirerat en ny metod för att ordna organismer evolutionärt i evolutionära träd. Sådana baserar man ofta på en handfull gener, som är starkt konserverade men ackumulerat små förändringar over evolutionens gång. Sung Hou Kim på University of California Berkeley har istället, tillsammans med sina medarbetare, tittat på frekvenser av korta DNA-snuttar hos organismer utan att ta hänsyn till gener eller andra kända genomiska element. Metoden hade först testats på litterära texter från Project Gutenberg, där statistik över hur ofta olika 9-merer (snuttar av nio bokstäver) förekom – oavsett om de tillhörde samma ord eller ej – visade sig innehålla mer information om tillkomstår och författare än konventionell analys baserad på ordfrekvenser. I sin analys av olika genom använde forskarna 18-merer av baspar och 20-merer av aminosyror för att klassificera däggdjurs- respective bakteriegenom. Resultaten blev bra men tog 320 processorår att beräkna. I framtiden hoppas professor Kim kunna använda sin metod för att fastställa vilka av Shakespeares påstådda verk som är skrivna av samma författare.

Källa: UC Berkeley
Kommentera en artikel
Utvalda artiklar

Nyhetsbrev

Sänd till en kollega

0.078