vilka DNA-fragment som tillhör samma art från en ”soppa” av bakterier som sekvenserats samtidigt.
bakteriers DNA kan forskare få en bättre förståelse för hur bakterier fungerar och interagerar med sin omgivning. Problemet hittills har varit att det gått ganska långsamt att studera arvsmassan i bakterierna var och en för sig.
bakterier varit svåra att odla i laboratorium delvis för att de är beroende av andra bakterier runt omkring sig.
man extraherar DNA från ett prov och sekvenserar miljontals korta DNA-bitar som sedan pusslas ihop i datorn till längre genom-fragment. Kruxet är sedan att lista ut vilka genomfragment som tillhör samma art. Det är detta problem som forskarlaget har en lösning på med sitt nya datorprogram som kallas för Concoct. Studien har publicerats i Nature Methods.
Läs mer på
Labtech Magazine.
BREAKING