DNA-sekvensering i USB-format
Den nya nanoporsekvenseringsmaskinen är stor som ett USB-minne och har skapat skyhöga förväntningar från marknaden.
Det är företaget Oxford Nanopore Technologies som efter mycket svett och kanske tårar äntligen visar upp sin första produkt, en produkt som de lovade skulle komma redan för ett och ett halvt år sedan. Minion avkodar DNA-fragment med en läslängd som vid de första användartesterna visat sig vara i snitt fem kilobaser. En smärre revolution på pappret om man samtidigt tar i beaktande det kompakta formatet.
Men konkurrensen har till viss del kommit i kapp, och kanske gått förbi under väntetiden, och även andra plattformar som den från Pacific Biosciences klarar numera dessa läslängder. Långa läslängder leder i förlängningen till ett enklare jobb när man ska para ihop datan från de olika analyserade DNA-fragmenten till en helhet, till exempel ett helt genom. Nackdelarna med nanoporteknologin i Minion överväger dock fortfarande fördelarna, och mängden felaktigheter i datan är så pass stor att instrumentet troligtvis ännu inte är redo för en bred lansering.
