23948sdkhjf

Ny metod hittar aggressiva tumörer

| Av Lisa von Garrelts | Tipsa redaktionen

Forskare vid Karolinska institutet har utvecklat en ny och billig metod för att identifiera väldigt heterogena tumörer. Dessa är ofta mycket aggressiva och kräver därför en mer aggressiv behandling.

Det är vanligt att cancerceller uppvisar förändringar i antalet kopior av varje kromosom eller gen som förekommer i genuppsättningen. Detta fenomen kallas för CNA, copy number alteration. Inom samma tumör kan celler i olika delar av tumören ha varierande antal genkopior. Tumörer med många CNA brukar vara mycket aggressiva och är mer benägna att omvandlas, även efter tuffa behandlingar.

Nu har forskare vid Karolinska institutet och Science for life laboratory, SciLifeLab, utvecklat en ny metod kallad CUTseq, som kan bedöma mängd och typ av CNA i många olika delar av samma tumör, till en mycket lägre kostnad än befintliga metoder. Metoden presenteras i den vetenskapliga tidskriften Nature Communications.

– Jag ser framför mig många sätt att använda CUTseq vid cancerdiagnostik. Inom diagnostiken kommer det att bli allt vanligare med sekvensering av flera tumördelar för att fastställa vilka patienter som har mycket heterogena tumörer och därför behöver mer aggressiv behandling. Här tror jag att vår metod kan få stor betydelse, säger Nicola Crosetto i ett pressmeddelande. Han är forskare vid institutionen för medicinsk biokemi och biofysik, Karolinska institutet, och en av artikelns huvudförfattare.

Metoden kan användas med DNA från flera vävnadsprover och till och med från mycket små delar av tunna vävnadssnitt – den typ av prov som patologer vanligen använder sig av för att ställa cancerdiagnos med mikroskop.

Genom att märka DNA från flera områden i samma tumörprov med unika molekylära streckkoder kan man få en heltäckande bild av CNA-heterogeniteten i en tumör med ett enda sekvenseringsförsök.

CUTseq har dessutom andra tillämpningsområden än cancerdiagnostik, menar forskarna som utvecklat tekniken.

– Man skulle exempelvis kunna använda CUTseq som plattform för autentisering av cellinjer och för att övervaka genomstabiliteten i stora cellinjer och biobanker. Metoden skulle också kunna användas inom ekologi, som alternativ till annan genomsekvensering med så kallad reducerad representation, såsom RAD-seq, för kostnadseffektiv utvärdering av biologisk mångfald, säger Magda Bienko, forskare vid samma institution och artikelns andra huvudförfattare.

Håll dig uppdaterad med Life Science Sweden
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.

Kommentarer (1)
Startsidan just nu

Kvicksilver har upptäckts i hudkrämer

Efter att miljöinspektörer i Malmö vid kontroll i butik hittat hudkrämer som innehåller kvicksilver varnar Läkemedelsverket konsumenter från att köpa krämerna. Krämerna används för att bleka huden.

Hon blir ny vice vd på SwedenBio

Billigt läkemedel kan motverka behandlingsresistent leukemi

Hallå där Per Ängquist…

Krönika: ”Newsify your equity story!”

En uppmaning till noterade life science-bolag att uppgradera sin kommunikation från ”plikt” till värdebyggare

Göteborg ger namn åt ny antibiotikaresistent bakterie

Nyhetsbrev

Nässpray mot depression godkänd

Arkiv

Ny vd tar Kry in i nästa fas

Växlar upp sin roll efter två år som COO.

Data från Sigrid visar på motverkad viktuppgång

Ny studie på möss publicerad i Nanomedicine visar att Sigrids medicintekniska produkt SiPore15 motverkar viktuppgång. Detta öppnar vägen till nya behandlingar av fetma och diabetes.

Single Technologies tar in 15 miljoner

Förkylningsspray lanseras i Hongkong

Långtidsmedicinering vid schizofreni är säker

Överväger parallellnotering

30 nya läkemedel godkända av EMA 2019

En nedgång jämfört med året innan.

Sömnbrist gav ökade Alzheimermarkörer

17 nätdroger narkotikaklassas

Spago väljer huvudkandidat

Godkände 48 nya läkemedel 2019

Färre än 2018 men mer än dubbelt så många som år 2016.

Jobb & Karriär
Vd-byte på Alzecure

Krönika: Osjälviska aktörer framgångsrika i ekosystemen

“Berusad” efter att ha deltagit i eventet Uppsala Life som samlade 300 deltagare i Uppsala-regionen för att diskutera förutsättningar för framgångsrik life science har jag några viktiga reflektioner.

Graviditetsdiabetes omprogrammerar stamceller

Stamceller i navelsträngen påverkas – Kan öka risken för diabetes hos barnet.

Resistens vanligt vid ledprotesinfektioner

Får fängelsestraff för Crispr-bebisar

Tre års fängelse och böter blir forskaren He Jiankuis straff för sitt arbete med att ta fram världens första genmodifierade bebisar.

Jobb & Karriär
Ny chef på Oncopeptides

Lovande data för ALS-läkemedel

Billigare och tidigare upptäckt av cancer

Immunicums vd får lämna med omedelbar verkan

Jobb & Karriär
Alligator tappar chef

Jobb & Karriär
Lämnar Karo Pharma

Engage with your CMO early

From spin-off to phase II

Jobb & Karriär
Ny chef på Rhovac

Kopplar variant av vanligt herpesvirus till MS

Lovande effektdata från Cantargia

Innovationslunch på Karolinska

Hon ska utveckla framtidens sjukhus

Se alla Medlemsnytt

Live demo of ZEISS LSM 980 with Airyscan 2 in Malmö

Dr Karl Busch hederssenator vid Münchens universitet

Modern vakuumteknik för avgasning under extrudering

Busch Vacuum Solutions - World Market Leader 2020

Hög driftsäkerhet vid vakuumgenering inom plastindustrin

ZEISS Hour Seminar

Dolphin vätskeringvakuumpumpar

Workshop | Live Cell Imaging in Superresolution Mode

Cognate BioServices announces acquisition of Cobra Biologics

Effektiv vakuumförsörjning för tillverkning av husbilar

Mätteknik för vakuum i ny tappning

ZEISS Two-hour Seminar

ZEISS One-hour Seminar

Learn how you can benefit from ZEISS LSM 900 in less than an hour!

One-hour Seminar

Förberedd för industri 4.0: Ny lamellvakuumpump med tryckreglering

Med månadens ZEISS Quiz kan du testa dina kunskaper i mätteknik och fira vårt 100-årsjubileum

Med månadens ZEISS Quiz kan du testa dina kunskaper i mätteknik och fira vårt 100-årsjubileum

Om du är intresserad av "Live Cell Imaging in Different Technologies", är den här workshop för dig!

R 5 0760 A PLUS den intelligenta vakuumpumpen med integrerad frekvensomvandlare

Med månadens ZEISS Quiz kan du testa dina kunskaper i mätteknik och fira vå...

Alitea-varumärket firar 40 år!

Förberedd för industri 4.0: Ny lamellvakuumpump med tryckreglering

Klovakuumpumpen Mink MV 0312 B från Busch Vakuumteknik – effektiv och tillf...

R 5 0760 A PLUS den intelligenta vakuumpumpen med integrerad frekvensomvand...

Sänd till en kollega

0.1