23948sdkhjf

AI hittar ny antibiotika

| Av Erika Lindbom Sierakowiak | Tipsa redaktionen

Tidigare diabeteskandidat uppvisar lovande egenskaper – Hittades av maskininlärningsalgoritm.

Med hjälp av en algoritm för maskininlärning har forskare vid amerikanska MIT identifierat en ny substans med starka bakteriedödande egenskaper. Algoritmen kan screena hundramiljontals kemiska substanser på bara några dagar, enligt universitetet. Den är utvecklad för att hitta bakteriedödande substanser som har en annan verkningsmekanism än de som redan är i bruk idag. I just det här fallet sökte man efter substanser som enligt algoritmen borde kunna döda bakterier av arten Escherichia coli, E. coli.

Algoritmen ”tränades upp” med information om 2 500 substanser, varav 1 700 var läkemedel som i dagsläget är godkända av FDA och 800 var naturligt förekommande substanser med olika utseende och aktivitet. När algoritmen sedan fick scanna igenom ett bibliotek med 6 000 substanser hittades en ny molekyl som hade en kemisk struktur som var olik den som finns hos kända typer av antibiotika samt som förutsågs ha en stark bakteriedödande effekt. Det var halocin, som tidigare utvärderats som ett potentiellt diabetesläkemedel. Halocin har fått sitt namn efter Hal, en artificiell intelligens i Stanley Kubrick-filmen År 2001: Ett rymdäventyr.

Med hjälp av en annan maskininlärningsalgoritm kunde forskarna se att halocin förmodligen inte har någon toxisk effekt på mänskliga celler.

Läs också: Avloppsvatten bör renas bättre för att motverka antibiotikaresistens

I in vitro-studier har halocin visat sig effektivt kunna döda många olika typer av sjukdomsframkallande bakterier, bland annat multiresistenta sådana, såsom Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii och Mycobacterium tuberculosis. Dock fungerar den inte mot Pseudomonas aeruginosa.

Substansen har även testats i två olika musmodeller där den bland annat visade sig kunna döda av infektioner med multiresistent A. Baumannii.

Enligt preliminära studier dödar halocin bakterier genom att störa deras förmåga att upprätthålla en elektrokemisk gradient över cellmembranen. Forskarna tror att denna typ av mekanism borde vara svår för bakterier att utveckla resistens mot och enligt en studie utvecklade E. coli-bakterier ingen resistens mot halocin under en 30 dagar lång behandling. Det kan jämföras med antibiotikumet ciprofloxacin, där resistens började utvecklas inom 1-3 dagar.

Efter upptäckten av halocin har ytterligare drygt hundra miljarder substanser screenats med hjälp av algoritmen. Det tog tre dagar och resulterade i upptäckten av 23 nya kandidater som är strukturellt olika existerande antibiotika samt som förutspås vara icke-toxiska för mänskliga celler. Åtta av dessa uppvisade bakteriedödande egenskaper och två var extra effektiva. Nu väntar ytterligare studier på de nya substanserna, samtidigt som fler molekyler ska screenas. Dessutom planeras ett projekt där den artificiella intelligensens lärdomar ska användas för att designa ny antibiotika samt optimera existerande molekyler.

En artikel om den nya substansen har publicerats i tidskriften Cell.

Förutom halocin har forskarna har även upptäckt en rad andra, lovande substanser som ska utforskas vidare och förhoppningen är att AI-plattformen ska kunna leda oss in i en ny era för upptäckt av nya typer av antibiotika, dels genom screening och dels genom design av nya substanser med hjälp av de lärdomar som samlas in om bakteriedödande substanser. Det är en stor förhoppning, då de nya typer av antibiotika som kommit de senaste decennierna har varit väldigt få och de som faktiskt nått fram till marknaden mestadels har varit baserade på andra, redan godkända substanser.

Läs även Ny antibiotikaklass når fas III.

Mer om: antibiotika | halocin | MIT
Håll dig uppdaterad med Life Science Sweden

Jag accepterar Nordiske Mediers villkor och avtal

Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.

Kommentarer (0)

JOBB I FOKUS

Startsidan just nu

Life Science Sweden tar sommarledigt

Vi på redaktionen går på semester och är tillbaka den 3 augusti. Vi hoppas att ni får en riktigt trevlig sommar! 

Jobb & karriär
Flera förändringar i Oncopeptides ledning

Rockad och nyrekrytering karaktäriserar bolagets tillsättning av ny vd samt forskningschef.

Regeringen tillsätter coronakommission

Rekordmånga läser Life Science Sweden

Intresset för tidningen har ökat kraftigt. Under våren har antalet besökare tredubblats.

Finans
Lipigons nyemission övertecknad

Nyhetsbrev

Studie: Fler skulle kunna vara immuna mot covid-19

Preliminära resultat pekar på att fler kan vara immuna mot covid-19, även om de fått negativt antikroppssvar.

Arkiv

Gileads besked – så mycket kommer remdesivir kosta

Priset för att behandla en covid-19-patient med remdesvir landar på 21 800 kronor. – Det är lite lägre än vad jag trodde, säger Anders Sönnerborg till Life Science Sweden.

2

Krönika
Torgny Fornstedt: Analytisk kemi måste hitta tillbaka till sina rötter

Det behövs fler kunniga analytiska kemister både på universiteten och inom industrin, skriver Torgny Fornstedt i en krönika.

Keminyheter
Sverige vill ha en EU-gemensam kemikaliestrategi

Lovande resultat för oral terapi vid atopiskt eksem

Jobb & karriär
Mattias Bergqvist ny ledamot i Scandinavian CRO

2

Ledare
Samuel Lagercrantz: Bergström bra val som vaccinsamordnare

Valet av Richard Bergström som vaccinsamordnare för covid-19 är glädjande, skriver Life Science Swedens chefredaktör Samuel Lagercrantz i en kommentar till gårdagens besked.

Atrogi får anslag för fetmaforskning

Forskningsföretaget Atrogi har fått ett anslag från Eurostar för utveckling av en substans mot fetma.

LSS in English
Marie Gårdmark: Do EMA and FDA talk to each other?

Of course they do! The collaboration started already in 2003, writes Marie Gårdmark in a column.

Remdesivir på väg mot EU-godkännande

Det europeiska läkemedelsverket EMA:s vetenskapliga kommitté rekommenderar remdesivir för godkännande för behandling av covid-19.

Finans
Aegirbio debuterar på Nasdaq First North

Stor genomslagskraft för immunterapi i Sverige

Internationell uppståndelse kring Tegnells sommarprat

Utländska medier har uppmärksammat Anders Tegnells uttalande där han beskriver andra länders agerande kring coronapandemin som ”galenskap”.

Keminyheter
Rötter och grenar blir vårdkläder

2

Tom Britton: ”Nivån för flockimmunitet är lägre än vad vi trott”

Nya matematiska modeller pekar på att flockimmunitetsnivån är kraftigt lägre än vad man tidigare trott, och att immuniteten i dagsläget spelar en större roll, enligt en ny rapport.

Vitalis blir digital konferens

Jobb & karriär
Maja Johansson blir chef för nya vaccinanläggningen i Umeå

Sedan en månad tillbaka är Maja Johansson ny site manager för Diamyd Medicals nya tillverkningsenhet i Umeå.

Remdesivir ges till barn med covid-19 i ny studie

Finans
Avgiften för klinisk läkemedelsprövning ökar med 250 procent

Ansökningsavgiften för kliniska prövningar höjs från 50 000 kronor till 123 000–148 000 kronor till följd av en ny EU-förordning, enligt rapport från Läkemedelsverket.

Selectimmune rekryterar ny vd

Tillväxtanalys ska bevaka life-science industrins utveckling

Vinnova stödjer KTH:s testkit för antikroppar mot covid-19

Jobb & karriär
Abigo nyanställer

Elektas vd avgår med omedelbar verkan

Ansiktsmask krävs för covidskydd enligt Science-artikel

Jobb & karriär
Cellavision tappar vd

Keminyheter
Kemikalieinspektionen i topp i arbetsplatsranking

1

Apotea och Werlabs säljer antikroppstest för covid-19

Läkemedelsverket förbjuder ett till covidtest

Röntgen visar hur coronaviruset förökar sig

Jobb & karriär
Micropos får ny vd

Se alla Medlemsnytt

Cobra signs supply agreement with AstraZeneca

Ny medarbetare till PharmaRelations i Norge

PharmaRelations stärker upp med ny konsultchef

Join us for a webinar on confocal microscopy!

3D Scanning Systems - Innovative Solutions for 3D digitizin

Akut produktion av desinfektionsmedel med hjälp av Busch

Improve your metrology skills, also @home.

Leverans av Busch vakuumsystem till Brasilien

Cleaning and Disinfecting Microscope and Optical Components

Busch Vakuum Solutions levererar till sjukhus i Palestina

Are you working from home?

Busch Vacuum Solutions levererar till sjukhustrailers i USA

Centralisering av vakuum från Busch Vacuum Solutions

Increase efficiency in the lab!

Verifiering vid tillverkning av Ventilatorer

Busch levererar vakuumsystem till akutsjukhus i Madrid

Samarbete mellan Busch i Schweiz och Frankrike mot Corona

Rening av gaser med vakuumteknik från Busch Vacuum Solutions

Optimize measurement plans remotely with free ZEISS CALYPSO

Find what you need from the ZEISS Industrial Quality world.

Biofiltrering med Busch TYR Blåsmaskin

Ny Country Manager PharmaRelations Norge

Perfekt packad skinka med vakuum från Busch

Last week, we introduced ZEISS Lightsheet 7.

Fiskodling med vakuum från Busch Vacuum Solutions

Sänd till en kollega

0.125