23948sdkhjf

AI hittar ny antibiotika

| Av Erika Lindbom Sierakowiak | Tipsa redaktionen

Tidigare diabeteskandidat uppvisar lovande egenskaper – Hittades av maskininlärningsalgoritm.

Med hjälp av en algoritm för maskininlärning har forskare vid amerikanska MIT identifierat en ny substans med starka bakteriedödande egenskaper. Algoritmen kan screena hundramiljontals kemiska substanser på bara några dagar, enligt universitetet. Den är utvecklad för att hitta bakteriedödande substanser som har en annan verkningsmekanism än de som redan är i bruk idag. I just det här fallet sökte man efter substanser som enligt algoritmen borde kunna döda bakterier av arten Escherichia coli, E. coli.

Algoritmen ”tränades upp” med information om 2 500 substanser, varav 1 700 var läkemedel som i dagsläget är godkända av FDA och 800 var naturligt förekommande substanser med olika utseende och aktivitet. När algoritmen sedan fick scanna igenom ett bibliotek med 6 000 substanser hittades en ny molekyl som hade en kemisk struktur som var olik den som finns hos kända typer av antibiotika samt som förutsågs ha en stark bakteriedödande effekt. Det var halocin, som tidigare utvärderats som ett potentiellt diabetesläkemedel. Halocin har fått sitt namn efter Hal, en artificiell intelligens i Stanley Kubrick-filmen År 2001: Ett rymdäventyr.

Med hjälp av en annan maskininlärningsalgoritm kunde forskarna se att halocin förmodligen inte har någon toxisk effekt på mänskliga celler.

Läs också: Nyupptäckt resistensgen kan hota kraftfull antibiotika

I in vitro-studier har halocin visat sig effektivt kunna döda många olika typer av sjukdomsframkallande bakterier, bland annat multiresistenta sådana, såsom Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii och Mycobacterium tuberculosis. Dock fungerar den inte mot Pseudomonas aeruginosa.

Substansen har även testats i två olika musmodeller där den bland annat visade sig kunna döda av infektioner med multiresistent A. Baumannii.

Enligt preliminära studier dödar halocin bakterier genom att störa deras förmåga att upprätthålla en elektrokemisk gradient över cellmembranen. Forskarna tror att denna typ av mekanism borde vara svår för bakterier att utveckla resistens mot och enligt en studie utvecklade E. coli-bakterier ingen resistens mot halocin under en 30 dagar lång behandling. Det kan jämföras med antibiotikumet ciprofloxacin, där resistens började utvecklas inom 1-3 dagar.

Efter upptäckten av halocin har ytterligare drygt hundra miljarder substanser screenats med hjälp av algoritmen. Det tog tre dagar och resulterade i upptäckten av 23 nya kandidater som är strukturellt olika existerande antibiotika samt som förutspås vara icke-toxiska för mänskliga celler. Åtta av dessa uppvisade bakteriedödande egenskaper och två var extra effektiva. Nu väntar ytterligare studier på de nya substanserna, samtidigt som fler molekyler ska screenas. Dessutom planeras ett projekt där den artificiella intelligensens lärdomar ska användas för att designa ny antibiotika samt optimera existerande molekyler.

En artikel om den nya substansen har publicerats i tidskriften Cell.

Förutom halocin har forskarna har även upptäckt en rad andra, lovande substanser som ska utforskas vidare och förhoppningen är att AI-plattformen ska kunna leda oss in i en ny era för upptäckt av nya typer av antibiotika, dels genom screening och dels genom design av nya substanser med hjälp av de lärdomar som samlas in om bakteriedödande substanser. Det är en stor förhoppning, då de nya typer av antibiotika som kommit de senaste decennierna har varit väldigt få och de som faktiskt nått fram till marknaden mestadels har varit baserade på andra, redan godkända substanser.

Läs även Ny antibiotikaklass når fas III.

Mer om: antibiotika | halocin | MIT
Håll dig uppdaterad med Life Science Sweden
Är du prenumerant? Bli prenumerant

Med en prenumeration får du obegränsad tillgång till webbtidningen. Läs webbtidningen online.

Kommentarer (0)
Startsidan just nu

Covid-19-patienter kan få plasma från tillfrisknade

Behandlingsalternativen för patienter med svår covid-19 är få. Nu överväger svenska läkare att starta en klinisk studie med plasma från tillfrisknande personer, rapporterar Läkemedelsvärlden.

Nyupptäckt resistensgen kan hota kraftfull antibiotika

Svenskt biotech-företag hjälper danska forskare med coronavaccin

Bioteknikföretaget Attana reste under särskilda restriktioner in i Köpenhamn under veckan för att hjälpa danska forskare att starta nya experiment på väg mot ett vaccin mot covid-19.

Apoteksgruppen Karlshamn är Årets Franchisetagare

Nya regler underlättar för framställning av desinfektionsmedel

Folkhälsomyndigheten tar hjälp av näringslivet för att öka testkapaciteten av covid-19

Nyhetsbrev

WHO startar insamling för covid-19

Arkiv

Intervju: ”Vi har blivit ett mer moget bolag”

Xspray Pharma byter börslista – ”Skulle kunna ta runt halva marknaden på bara ett par veckor”

EU kan skjuta upp nya regler för medicinteknik

Vaccination mot pneumokocker eller influensa skyddar inte mot covid-19

Nu meddelar Folkhälsomyndigheten att vaccination mot varken influensa eller pneumokocker skyddar mot lunginflammation orsakad av sjukdomen covid-19.

”Den viktigaste milstolpen hittills”

Lunds universitet forskar om coronavirus i luften

Toleranzia får 2 miljoner kronor från Vinnova

Novavax utvecklar coronavaccin

Inom ett och ett halvt år kan ett vaccin mot det nya coronaviruset vara tillgängligt. Det har redan visat lovande resultat i djurstudier. – Vi har möjlighet att göra en stor insats för mänskligheten, det är klart att vi alla pressas i verksamheten att göra vårt yttersta, säger Gregory Glenn, på Novavax.

Lunds universitet hoppas att AI kan underlätta för patologer

Cobra Biologics ska framställa coronavaccin i Matfors

Cobra Biologics är ett av få företag i världen som kan framställa DNA-plasmider i större skala. Nu arbetar fabriken i Matfors tillsammans med Karolinska Institutets covid-19-grupp för att ta fram ett vaccin mot det nya coronaviruset.

Två självtester för covid-19 stoppas

3

Medicinhistoriker: "Vänta med karantän"

Flera länder sätter sin befolkning i karantän och samtidigt får svenska regeringen kritik för sin mer återhållsamma linje. Det finns dock både hälsomässiga och samhällsekonomiska skäl att vänta med en strikt karantän. – Karantänvapnet måste man vänta med till absolut rätt tillfälle. Då ska det vara en hård karantän där i princip ingen får gå ut opåkallat, säger medicinhistoriken Peter M Nilsson.

Studie: Typ 2-diabetes vanligare hos män med tidig pubertet

Astrazeneca donerar 9 miljoner ansiktsmasker

Intervju: Svenskt företag i vaccinracet

Om ett par veckor startar Stockholmsbaserade ISR upp in vivo-studier med ett nytt inhalationsvaccin mot Corona – "Bra att vara beredda med ett vaccin som man kan utgå ifrån när covid-20 eller -21 kommer."

Studie: Linagliptin gav inga hjärt- eller njurskador hos äldre med typ 2-diabetes

Materielbristen förväntas bli värre under veckan

Forskare har hittat sätt att rensa kroppen på triglycerider

EU-kommissionen startar lager för medicinsk utrustning

Jobb & Karriär
Nya ledamöter i Kungliga Vetenskapsakademin

Fortsatt brist på skyddsmaterial – andningsmasker på väg

Hård kritik mot Varuförsörjningsnämnden

Socialstyrelsen ska styra upp fler intensivvårdsplatser

Förändringar i cellernas nedbrytningscentraler kan leda till cancer

Vitalis flyttas till sommaren

Sjukvårdsutrustning stoppas av stängda gränser

Studie: Uppföljning med telemedicin effektivt vid sömnapnébehandling

Forskare använder VR-teknik för att designa nya läkemedel

Förpackning med Alvedon restnoterad

FDA skjuter upp alla utländska inspektioner

Se alla Medlemsnytt

Perfekt packad skinka med vakuum från Busch

Last week, we introduced ZEISS Lightsheet 7.

Fiskodling med vakuum från Busch Vacuum Solutions

Busch Vacuum Solutions

Energieffektiv produktion med centralvakuum

Stor energibesparing med centralvakuum i förpackningsprocess

Milmed, en effektiv utmanare till Antihistaminer

Vakuumpumpar från Busch till kinesiska sjukhus

Live demo of ZEISS LSM 980 with Airyscan 2 in Malmö

Dr Karl Busch hederssenator vid Münchens universitet

Modern vakuumteknik för avgasning under extrudering

Busch Vacuum Solutions - World Market Leader 2020

Hög driftsäkerhet vid vakuumgenering inom plastindustrin

ZEISS Hour Seminar

Dolphin vätskeringvakuumpumpar

Workshop | Live Cell Imaging in Superresolution Mode

Cognate BioServices announces acquisition of Cobra Biologics

Effektiv vakuumförsörjning för tillverkning av husbilar

Mätteknik för vakuum i ny tappning

ZEISS Two-hour Seminar

ZEISS One-hour Seminar

Learn how you can benefit from ZEISS LSM 900 in less than an hour!

One-hour Seminar

Förberedd för industri 4.0: Ny lamellvakuumpump med tryckreglering

Med månadens ZEISS Quiz kan du testa dina kunskaper i mätteknik och fira vå...

Sänd till en kollega

0.141